宮原 渉 (Wataru Miyahara)
Computational toxicology researcher focused on interpretable ML and cheminformatics.
明治薬科大学 薬学部薬学科（2028年3月卒業予定）
医療分子解析学研究室（研究メンバー） 所属
研究領域 (Research Focus)
- 副作用発現メカニズムの探求:
Kolmogorov-Arnold Networks (KAN) の解釈性を活用したToxicophore（毒性発現部位）の同定に取り組んでいます。高次元入力時の計算コスト増大や過学習への脆弱性といったKAN固有の技術的限界を客観的に評価し、アーキテクチャの最適化を通じたトレードオフの克服と、分子・受容体レベルでの安全性評価基盤の構築を目指しています。
- 実臨床データ（RWD）解析への展開:
自発報告データベース（FAERS）での知見をベースとした、実臨床データ解析への拡張を検証しています。
これまでの歩み (Recent Achievements)
- EUOS25 challenge 光学特性予測部門 優勝（2026年2月）
- 具体的貢献: 量子化学計算による構造最適化、Sequential Stackingアーキテクチャの設計・実装を主導しました。[Status: In preparation] [技術解説] [公式発表]
- 第146年会 日本薬学会 ポスター発表（2026年3月）
- FAERSとKANを用いた横紋筋融解症の構造的特徴解明について発表しました。
専門能力・実装実績 (Skills & Experience)
- 機械学習 (KAN / GBDT / GNN): 予測アーキテクチャの設計・実装。
- 計算化学 (Cheminformatics): RDKitを用いた特徴量抽出、量子化学計算(MOPAC/xTB)ワークフローの構築。
- ツール開発: 学会発表やコンテスト解析に活用した ECFP生成ツール や 記述子算出ツール の開発。
Contact & Profiles
Wataru Miyahara
Computational toxicology researcher focused on interpretable ML and cheminformatics.
Meiji Pharmaceutical University, Faculty of Pharmacy (Class of 2028)
Research Affiliation: Laboratory of Medical Molecule Analysis (Members)
Research Focus
- Investigating Adverse Event Mechanisms:
Identifying Toxicophores using KAN interpretability. My work focuses on addressing the inherent trade-offs of KAN, such as computational bottlenecks and susceptibility to overfitting in high-dimensional settings, through architectural optimization to build a robust safety assessment framework.
- Expansion to RWD Analysis:
Validating the application of FAERS-based findings to clinical data analysis using Japanese claims data.
My Journey
Skills & Experience
- Machine Learning (KAN / GBDT / GNN): Design and implementation of predictive architectures, with a focus on controlling KAN’s scalability limitations.
- CompChem: Feature extraction via RDKit and biophysical property estimation using MOPAC/xTB workflows.
- Software Development: Developer of ecfp_cli and mordred_descriptor_calculator, utilized in academic presentations and challenges.
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